MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli IAI1 chromosome

Total Repeats: 96605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011741	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011741	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011741	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011741	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011741	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011741	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552586
7	NC_011741	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552586
8	NC_011741	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011741	T	8	8	302	309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011741	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011741	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
12	NC_011741	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	218552587
13	NC_011741	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	218552587
14	NC_011741	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	218552587
15	NC_011741	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
16	NC_011741	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
17	NC_011741	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	218552587
18	NC_011741	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552587
19	NC_011741	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
20	NC_011741	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
21	NC_011741	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	218552587
22	NC_011741	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
23	NC_011741	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552587
24	NC_011741	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552587
25	NC_011741	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
26	NC_011741	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
27	NC_011741	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
28	NC_011741	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	218552587
29	NC_011741	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
30	NC_011741	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	218552587
31	NC_011741	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
32	NC_011741	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552587
33	NC_011741	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
34	NC_011741	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
35	NC_011741	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	218552587
36	NC_011741	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
37	NC_011741	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
38	NC_011741	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	218552587
39	NC_011741	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552587
40	NC_011741	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552587
41	NC_011741	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552587
42	NC_011741	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
43	NC_011741	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
44	NC_011741	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
45	NC_011741	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552587
46	NC_011741	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	218552587
47	NC_011741	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552587
48	NC_011741	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
49	NC_011741	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552587
50	NC_011741	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	218552587
51	NC_011741	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552587
52	NC_011741	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
53	NC_011741	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
54	NC_011741	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552587
55	NC_011741	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
56	NC_011741	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
57	NC_011741	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552587
58	NC_011741	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
59	NC_011741	ATTGAA	2	12	2430	2441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218552587
60	NC_011741	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
61	NC_011741	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552587
62	NC_011741	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	218552587
63	NC_011741	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
64	NC_011741	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552587
65	NC_011741	TGCC	2	8	2594	2601	0 %	25 %	25 %	50 %	218552587
66	NC_011741	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218552587
67	NC_011741	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552587
68	NC_011741	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552588
69	NC_011741	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552588
70	NC_011741	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552588
71	NC_011741	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	218552588
72	NC_011741	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552588
73	NC_011741	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	218552588
74	NC_011741	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552588
75	NC_011741	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552588
76	NC_011741	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552588
77	NC_011741	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552588
78	NC_011741	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552588
79	NC_011741	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	218552588
80	NC_011741	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552588
81	NC_011741	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552588
82	NC_011741	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	218552588
83	NC_011741	CTGG	2	8	3418	3425	0 %	25 %	50 %	25 %	218552588
84	NC_011741	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	218552588
85	NC_011741	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552588
86	NC_011741	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	218552588
87	NC_011741	TCCGGC	2	12	3577	3588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218552588
88	NC_011741	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552588
89	NC_011741	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	218552589
90	NC_011741	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	218552589
91	NC_011741	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
92	NC_011741	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
93	NC_011741	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	218552589
94	NC_011741	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552589
95	NC_011741	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552589
96	NC_011741	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
97	NC_011741	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552589
98	NC_011741	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	218552589
99	NC_011741	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552589
100	NC_011741	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552589
101	NC_011741	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552589
102	NC_011741	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552589
103	NC_011741	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552589
104	NC_011741	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552589
105	NC_011741	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552589
106	NC_011741	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
107	NC_011741	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	218552589
108	NC_011741	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552589
109	NC_011741	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552589
110	NC_011741	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552589
111	NC_011741	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552589
112	NC_011741	T	6	6	5070	5075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011741	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011741	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011741	CGT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011741	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552590
117	NC_011741	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552590
118	NC_011741	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552590
119	NC_011741	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552590
120	NC_011741	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552590
121	NC_011741	CCA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552590
122	NC_011741	CTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218552590
123	NC_011741	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552590
124	NC_011741	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552590
125	NC_011741	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011741	CGC	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_011741	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552591
128	NC_011741	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218552591
129	NC_011741	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552591
130	NC_011741	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552591
131	NC_011741	CAGT	2	8	5765	5772	25 %	25 %	25 %	25 %	218552591
132	NC_011741	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552591
133	NC_011741	TCA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552591
134	NC_011741	TTC	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552591
135	NC_011741	TTC	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218552591
136	NC_011741	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552591
137	NC_011741	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552591
138	NC_011741	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218552591
139	NC_011741	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552591
140	NC_011741	AAATCG	2	12	6151	6162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218552591
141	NC_011741	AGCG	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	218552591
142	NC_011741	CTG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552591
143	NC_011741	TGG	2	6	6401	6406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218552591
144	NC_011741	A	7	7	6495	6501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011741	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552592
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149	NC_011741	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552592
150	NC_011741	GCT	2	6	7111	7116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552592
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153	NC_011741	GCCA	2	8	7226	7233	25 %	0 %	25 %	50 %	218552592
154	NC_011741	CAG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552592
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156	NC_011741	CG	3	6	7553	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	218552592
157	NC_011741	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218552592
158	NC_011741	CG	3	6	7745	7750	0 %	0 %	50 %	50 %	218552592
159	NC_011741	CAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218552592
160	NC_011741	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552592
161	NC_011741	A	6	6	7945	7950	100 %	0 %	0 %	0 %	218552592
162	NC_011741	GCAT	2	8	7955	7962	25 %	25 %	25 %	25 %	218552592
163	NC_011741	AAG	2	6	8018	8023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011741	TA	3	6	8024	8029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011741	GGCG	2	8	8086	8093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
166	NC_011741	CGG	2	6	8150	8155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_011741	CGT	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_011741	ATC	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_011741	ACC	2	6	8270	8275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552593
170	NC_011741	CAAC	2	8	8334	8341	50 %	0 %	0 %	50 %	218552593
171	NC_011741	TC	3	6	8345	8350	0 %	50 %	0 %	50 %	218552593
172	NC_011741	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	218552593
173	NC_011741	TTGA	2	8	8387	8394	25 %	50 %	25 %	0 %	218552593
174	NC_011741	CAG	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552593
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176	NC_011741	CAG	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218552593
177	NC_011741	CGAC	2	8	8454	8461	25 %	0 %	25 %	50 %	218552593
178	NC_011741	TGC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218552593
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189	NC_011741	CTGT	2	8	9239	9246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
190	NC_011741	TGA	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218552594
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201	NC_011741	G	6	6	9909	9914	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
202	NC_011741	AGAT	2	8	9994	10001	50 %	25 %	25 %	0 %	218552595
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215	NC_011741	GAAT	2	8	10515	10522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
216	NC_011741	AAT	2	6	10528	10533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
217	NC_011741	ATA	2	6	10569	10574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
218	NC_011741	GAAAAT	2	12	10612	10623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
219	NC_011741	GCAG	2	8	10671	10678	25 %	0 %	50 %	25 %	218552596
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240	NC_011741	CTG	2	6	11836	11841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_011741	AGA	2	6	11848	11853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
242	NC_011741	TCTTT	2	10	11867	11876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
243	NC_011741	TTA	2	6	11877	11882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_011741	T	6	6	11886	11891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_011741	ATTC	2	8	11911	11918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
246	NC_011741	A	6	6	11991	11996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_011741	TGA	2	6	12014	12019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
248	NC_011741	TAG	2	6	12039	12044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_011741	AGTG	2	8	12053	12060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
250	NC_011741	A	7	7	12068	12074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_011741	ATG	2	6	12130	12135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_011741	AT	3	6	12141	12146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_011741	AAT	2	6	12170	12175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218552598
254	NC_011741	TAC	2	6	12191	12196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552598
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256	NC_011741	CAC	2	6	12224	12229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552598
257	NC_011741	CAC	2	6	12263	12268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218552598
258	NC_011741	TGGT	2	8	12307	12314	0 %	50 %	50 %	0 %	218552598
259	NC_011741	GCC	2	6	12382	12387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552598
260	NC_011741	GAA	2	6	12399	12404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218552598
261	NC_011741	CAT	2	6	12422	12427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218552598
262	NC_011741	ATT	2	6	12438	12443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218552598
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264	NC_011741	CCG	2	6	12495	12500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218552598
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266	NC_011741	A	7	7	12522	12528	100 %	0 %	0 %	0 %	218552598
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500	NC_011741	TAA	2	6	22426	22431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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